Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fbxo18Q8K2I9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fbxo18Q8K2I9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fbxo18Q8K2I9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fbxo18Q8K2I9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fbxo18Q8K2I9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fbxo18Q8K2I9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fbxo18Q8K2I9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fbxo18Q8K2I9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Fbxo18Q8K2I9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms