Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Depp1Q8K2F3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms