Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtf3c1Q8K284 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3c1Q8K284 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms