Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Abcf3Q8K268 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Abcf3Q8K268 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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