Protein–RNA interactions for Protein: Q8K136

Scnm1, Sodium channel modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnm1Q8K136 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnm1Q8K136 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms