Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms