Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SbsnQ8CIT9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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SbsnQ8CIT9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SbsnQ8CIT9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SbsnQ8CIT9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SbsnQ8CIT9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SbsnQ8CIT9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SbsnQ8CIT9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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