Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CopaQ8CIE6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms