Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rab11fip3Q8CHD8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip3Q8CHD8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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