Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Pramef8Q8CE24 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef8Q8CE24 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Pramef8Q8CE24 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef8Q8CE24 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef8Q8CE24 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef8Q8CE24 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Pramef8Q8CE24 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef8Q8CE24 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Pramef8Q8CE24 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Pramef8Q8CE24 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pramef8Q8CE24 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pramef8Q8CE24 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pramef8Q8CE24 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pramef8Q8CE24 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pramef8Q8CE24 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pramef8Q8CE24 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef8Q8CE24 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pramef8Q8CE24 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms