Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc17Q8CE13 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms