Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph6aQ8CDR2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms