Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc87Q8CDL9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms