Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhlrc3Q8CCH2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms