Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAI1

Ccdc142, Coiled-coil domain-containing protein 142, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc142Q8CAI1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc142Q8CAI1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc142Q8CAI1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms