Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc159Q8C963 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc159Q8C963 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms