Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dclre1bQ8C7W7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dclre1bQ8C7W7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms