Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms