Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cnot2Q8C5L3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot2Q8C5L3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms