Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc60Q8C4J0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc60Q8C4J0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms