Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q8C3W1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8C3W1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8C3W1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8C3W1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8C3W1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms