Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C1R3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C1R3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C1R3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C1R3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C1R3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C1R3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms