Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B1

Camsap2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap2Q8C1B1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Camsap2Q8C1B1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Camsap2Q8C1B1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Camsap2Q8C1B1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms