Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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