Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssc5dQ8BV57 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms