Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Pggt1bQ8BUY9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Pggt1bQ8BUY9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pggt1bQ8BUY9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms