Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pbrm1Q8BSQ9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pbrm1Q8BSQ9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pbrm1Q8BSQ9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pbrm1Q8BSQ9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms