Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fndc9Q8BJN4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc9Q8BJN4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms