Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rufy1Q8BIJ7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy1Q8BIJ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy1Q8BIJ7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy1Q8BIJ7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy1Q8BIJ7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy1Q8BIJ7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy1Q8BIJ7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy1Q8BIJ7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy1Q8BIJ7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy1Q8BIJ7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms