Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D130040H23RikQ8BII3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
D130040H23RikQ8BII3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
D130040H23RikQ8BII3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D130040H23RikQ8BII3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
D130040H23RikQ8BII3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
D130040H23RikQ8BII3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D130040H23RikQ8BII3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D130040H23RikQ8BII3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D130040H23RikQ8BII3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D130040H23RikQ8BII3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
D130040H23RikQ8BII3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms