Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms