Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV5

Znf8, Zinc finger protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf8Q8BGV5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Znf8Q8BGV5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Znf8Q8BGV5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf8Q8BGV5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms