Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp4f39Q8BGU0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp4f39Q8BGU0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms