Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG27

9930022D16Rik, RIKEN cDNA 9930022D16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930022D16RikQ8BG27 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9930022D16RikQ8BG27 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9930022D16RikQ8BG27 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9930022D16RikQ8BG27 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9930022D16RikQ8BG27 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9930022D16RikQ8BG27 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9930022D16RikQ8BG27 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9930022D16RikQ8BG27 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9930022D16RikQ8BG27 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms