Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd4Q8BFT6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms