Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atg4cQ811C2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg4cQ811C2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms