Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfascQ810U3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfascQ810U3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms