Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc172Q810N9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms