Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim19Q80ZU4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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