Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cldn34b3Q80ZS5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms