Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cracr2bQ80ZJ8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms