Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TnnQ80Z71 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TnnQ80Z71 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TnnQ80Z71 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TnnQ80Z71 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TnnQ80Z71 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TnnQ80Z71 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms