Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Zbed4Q80WQ9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Zbed4Q80WQ9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zbed4Q80WQ9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed4Q80WQ9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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