Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM4

Hapln4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln4Q80WM4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hapln4Q80WM4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln4Q80WM4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms