Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ6

Abcc12, Multidrug resistance-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc12Q80WJ6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms