Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc155Q80VJ8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc155Q80VJ8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms