Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

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Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Arhgef17Q80U35 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Arhgef17Q80U35 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgef17Q80U35 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgef17Q80U35 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgef17Q80U35 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgef17Q80U35 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgef17Q80U35 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgef17Q80U35 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Arhgef17Q80U35 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Arhgef17Q80U35 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgef17Q80U35 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgef17Q80U35 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms