Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pja2Q80U04 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pja2Q80U04 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pja2Q80U04 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pja2Q80U04 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pja2Q80U04 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms