Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdc42bpbQ7TT50 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms