Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ube2q1Q7TSS2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2q1Q7TSS2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms